在《百年孤独》这部小说中，苏西和贝利的关系确实充满了曲折和神秘，但小说并没有明确说明他们最终没有在一起的具体原因。以下是一些可能的解释：
命运的安排：
在《百年孤独》中，人物的命运往往受到神秘力量和无形因素的影响。苏西和贝利的关系可能也受到了这种命运安排的影响，导致他们最终无法走到一起。
个人选择：
苏西在小说的某个章节中选择了和自己的表弟胡安马克多结婚，并生了一个儿子。这表明苏西在面对感情和生活选择时，可能更倾向于稳定和传统的家庭生活，而不是追求与贝利之间的感情。
贝利的变化：
贝利在小说中逐渐变成了一个神秘的半面人物，并最终消失在了历史的长河中。这种变化可能意味着贝利本身也面临着某种无法抗拒的命运或转变，导致他无法与苏西在一起。
小说的主题：
《百年孤独》的主题之一是探讨孤独和命运的不可避免性。苏西和贝利的关系可能也是这一主题的体现，他们虽然彼此吸引，但最终无法逃脱孤独的命运。
综上所述，虽然苏西和贝利在小说中有过短暂的相处和互相的吸引，但由于多种可能的原因，他们最终没有在一起。这些原因包括命运的安排、个人选择、贝利的变化以及小说的主题等。