关于三年级上册学生敢于质疑的小故事，综合相关教学案例和名人故事，可以整理如下：
一、孙中山的求知精神
《不懂就要问》是小学语文人教版三年级上册的经典课文，讲述了孙中山小时候在私塾读书时，因不理解课文内容而大胆向先生请教的故事。他不顾先生责骂，坚持追求真理，体现了“学问学问，不懂就要问”的求知态度。
二、科学史上的质疑精神
伽利略与比萨斜塔实验
伽利略挑战亚里士多德关于重物下落速度的权威观点，通过比萨斜塔实验证明不同重量的物体同时落地，开创了近代科学实验的先河。
哥白尼与日心说
哥白尼提出“日心说”，将地球从宇宙中心改为太阳系行星，动摇了教会权威。布鲁诺进一步发展为“太阳中心说”，但遭宗教裁判所迫害致死。
三、历史人物与教育案例
布鲁诺的信仰与牺牲
布鲁诺坚持唯物主义宇宙观，反对教会教义，被宗教裁判所囚禁8年后被火刑处决，成为反宗教迫害的象征。
蒙古宰相脱脱的求知欲
元朝宰相脱脱幼时质疑死记硬背的教学方法，建议结合故事讲解，后成为明理求知的典范。
四、现代教育中的质疑意识
小红与英语课代表身份
高二学生小红因认为英文小说对英语学习无意义而质疑课程安排，最终以平和态度与老师沟通，获得认可。
总结
这些故事涵盖科学探索、历史事件和现代教育场景，通过孙中山、伽利略、布鲁诺等人物，展现了不同领域中敢于质疑的精神。对于学生而言，这些案例不仅是知识的补充，更是培养批判性思维和独立人格的启示。