《东邪西毒》终极版与原版的区别主要体现在以下几个方面：
画面修复
终极版对1994年版本进行了全面的数字修复，画面色彩更加鲜艳，每一幅画面都宛若油画一般。
声效升级
原版《东邪西毒》配的是单声道，而终极版将其修复成了5.1环绕立体声，提供了更加震撼的听觉体验。
时长缩短
相比原版的100分钟片长，终极版的片长缩短至93分钟。
镜头删减
终极版删除了一些镜头，包括开头西毒的打斗戏、盲剑客的对战马贼的戏、以及片尾的大战部分等。
增加了刘嘉玲在水中骑马的特写镜头，以及一大幅晶莹水珠的画面，以突出林青霞的角色。
为了表达对张国荣的敬意，王家卫在影片最后特别为他留了一个镜头。
配乐修改
终极版进行了重新配乐，移除了三段场景中梦幻般的音乐。
叙事结构
终极版采用了时间线是中国传统节气的方式，从惊蛰到夏至到白露到立春，把故事中人物关系交代得更清楚。
其他细节
影片一开始的图像略微有些不同，王家卫在一场风暴中加入了一个巨大的黄色月亮。
一些武打戏份有所删减，例如梁朝伟杀马贼的那场戏就剪短了。
删除了东邪吃梨的镜头、新婚夜闪回的镜头、洪七老婆照顾洪七的场景等。
总的来说，《东邪西毒》终极版在画面、声效、时长、镜头、配乐和叙事结构等方面都进行了修复和修改，使得影片在视觉上更加鲜艳，听觉上更加震撼，故事结构也更加清晰。尽管改动不大，但这些细微的调整使得影片在观众中获得了更好的口碑。