《致我们终将逝去的青春》中陈孝正和郑微没有在一起的原因是多方面的，主要包括以下几点：
陈孝正的出国选择：
陈孝正为了追求学业和事业，选择了出国，并且告诉郑微不要等他。这一决定实际上为他们的关系划上了句号。
陈孝正的自卑和功利心：
陈孝正家境贫寒，从小自卑，母亲的压力使他具有强烈的功利心，一心要出人头地。他认为自己给不了郑微美好的未来，因此选择了放弃爱情，选择了自己想要过的生活。
郑微的宽容和原谅：
郑微虽然对陈孝正的辜负感到伤心，但她原谅了这个给过她辜负的男人，也原谅了自己年少时不问因由的爱。
命运的安排：
郑微在施洁的身上看到了自己，不想重蹈覆辙，所以选择了和林静在一起。而陈孝正在回国后，虽然后悔当初与郑微分手，但一切已经无法挽回。
综上所述，陈孝正和郑微没有在一起是由于陈孝正的出国选择、自卑和功利心、郑微的宽容和原谅以及命运的安排等多重因素共同作用的结果。