卫生院财务会计的主要职责包括：
日常会计核算
按照会计制度和医院财务管理规定，及时、准确地进行日常账务处理，确保所有财务数据的准确性和完整性。
审核日常报销凭证，杜绝多报、假报、虚报、无证报销现象。
负责审核收付款凭证，保证债权债务的真实准确。
账务处理与凭证管理
严格执行操作流程，确保财务凭证的及时整理与归档，保障财务资料的完整性与可追溯性。
负责账簿的登记、结账、对账工作，确保科目准确、数字真实、账账相符。
财务报表与财务分析
根据财务科的安排，按时编制医院月度、季度和年度财务报表，并进行数据分析，发现财务运行中的异常问题，及时向上级领导报告。
编制的报表要做到数字真实、准确、衔接，做到账表对口，并认真分析，有情况、有说明，经院长核准，按时上报。
税务与保险管理
负责税收申报和缴纳，及时准确地完成税务申报，力求节税。
核实人事部提供的薪金发放名册，按时发放公司职工的工资、奖金。
负责及时、准确解缴各种社会统筹保险、住房公积金等工作。
资金管理与预算执行
精确计提缴纳税款和单位供款，监督机构经营情况，确保及时准确的支付各项经费，并对资金的利用进行审计。
配合财务科长做好预算执行情况的跟踪，及时汇总并报告各科室的预算执行情况，发现预算执行偏差时，主动向财务科长反馈，并协助相关部门进行调整与改进。
成本核算与控制
负责部分科室的成本核算工作，在财务科长的指导下，结合医疗服务的实际情况，准确计算各项业务的成本，并对成本支出进行合理的控制与分析。
建立与登记库存药品明细帐，进行药品盘点，确保帐帐相符、帐实相符。
信息系统与档案保管
维护财务统计系统，保证数据隐私和准确性。
负责会计档案的保管。
其他财务相关工作
参与资金的管理与决策，提出合理化建议和方案，改善经营管理。
协助编制预算，控制预算定额，合理使用资金，以保证医院各项事业的需要。
这些职责涵盖了卫生院财务会计的各个方面，从日常的账务处理到财务报表的编制，再到税务和保险的管理，以及成本的控制和资金的管理等。