倪萍的现任丈夫是杨亚洲，他们于2005年低调结婚，并育有一子。杨亚洲是一位著名的影视剧导演，倪萍曾多次主演其导演的作品。
倪萍的情感历程充满了起伏，她经历了多次婚姻的波折，其中包括与知名导演陈凯歌的一段深刻但未竟的恋情。在一次访谈中，她坦露心迹：“我仍然相信爱情，但对婚姻已失去幻想，倡导慎重对待婚姻，绝非仅为结婚而结合。”。
在与杨亚洲相识之前，倪萍的第一任丈夫是山东时结合的，早年在山东工作的倪萍因赌气匆匆走进婚姻，并育有一女，后来，28岁的倪萍调到北京中央电视台工作后，二人分道扬镳。1997年，倪萍与王文澜结婚，1999年40岁的倪萍生下儿子虎子。2005年与王文澜离婚后不久，倪萍就与多次合作过的导演杨亚洲喜结连理，低调办完了婚事。
如今，倪萍和杨亚洲一直生活在北京的家中，共同度过每一天。他们的婚姻生活幸福美满，倪萍常常在节目中分享与丈夫生活的点滴，幸福的笑容挂在脸上，气色也越来越好。