在小说《悲伤逆流成河》中， 秦佩佩确实欺负了钟源。顾森西因为易遥的死很绝望，所以转学去了别的学校，在新的学校，顾森西遇到了秦佩佩和钟源，而钟源与易遥有些相似，让顾森西对她产生了好感。因为秦佩佩老是欺负钟源，所以她心生怨恨，报复秦佩佩，后被顾森西发现，导致顾森西彻底失望了，认为这个世上真的找不到和易瑶相像的女孩子。
此外，其他文档也提到了秦佩佩欺负钟源的情节。例如，齐铭和顾森西都不相信易遥，易遥感到很绝望，跳楼自杀，齐铭是开煤气自杀，顾森西转学，遇到了秦佩佩和钟源两个女生，秦佩佩一直欺负钟源，就像当初的唐小米和易遥一样。
因此，可以确定秦佩佩在小说中确实欺负了钟源。