三毛的《梦里花落知多少》版权属于三毛本人。这部小说是三毛在丈夫荷西去世后所写，记录了她对丈夫的思念和悲痛的心情，以及她慢慢走出阴霾的过程。这部作品是三毛后期风格的代表作之一，也是《三毛集》中的一卷。
尽管存在关于郭敬明也写过一本同名的小说《梦里花落知多少》的误解，但实际上，郭敬明的这部作品与三毛的原作在内容和风格上都有很大的不同。此外，郭敬明的《梦里花落知多少》被指控抄袭了庄羽的《圈里圈外》，但郭敬明最终选择了道歉并赔偿庄羽经济损失。
因此，可以明确地说，三毛的《梦里花落知多少》的版权是她的，与郭敬明无关。